Julkaisuja vuodessa
Julkaisuja vuodessa
Hakutulokset
-
2023
Circulating metabolic signatures of rapid and slow progression to type 1 diabetes in islet autoantibody-positive children
Lamichhane, S., Sen, P., Dickens, A. M., Kråkström, M., Ilonen, J., Lempainen, J., Hyöty, H., Lahesmaa, R., Veijola, R., Toppari, J., Hyötyläinen, T., Knip, M. & Orešič, M., 6 syysk. 2023, julkaisussa: Frontiers in Endocrinology. 14, 9 Sivumäärä, 1211015.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto1 Sitaatiot (Scopus)7 Lataukset (Pure) -
Exhausted T cells hijacking the cancer-immunity cycle: Assets and liabilities
Brunell, A. E., Lahesmaa, R., Autio, A. & Thotakura, A. K., 14 huhtik. 2023, julkaisussa: Frontiers in Immunology. 14, 13 Sivumäärä, 1151632.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto2 Sitaatiot (Scopus)4 Lataukset (Pure) -
Gene expression signature predicts rate of type 1 diabetes progression
INNODIA Consortium, kesäk. 2023, julkaisussa: EBioMedicine. 92, 12 Sivumäärä, 104625.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto5 Sitaatiot (Scopus) -
HIC1 interacts with FOXP3 multi protein complex: Novel pleiotropic mechanisms to regulate human regulatory T cell differentiation and function
Andrabi, S. B. A., Batkulwar, K., Bhosale, S. D., Moulder, R., Khan, M. H., Buchacher, T., Khan, M. M., Arnkil, I., Rasool, O., Marson, A., Kalim, U. U. & Lahesmaa, R., marrask. 2023, julkaisussa: Immunology Letters. 263, s. 123-132 10 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
PIM kinases regulate early human Th17 cell differentiation
Buchacher, T., Shetty, A., Koskela, S. A., Smolander, J., Kaukonen, R., Sousa, A. G. G., Junttila, S., Laiho, A., Rundquist, O., Lönnberg, T., Marson, A., Rasool, O., Elo, L. L. & Lahesmaa, R., 26 jouluk. 2023, julkaisussa: Cell Reports. 42, 12, 19 Sivumäärä, 113469.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto1 Sitaatiot (Scopus)4 Lataukset (Pure) -
Profiling of peripheral blood B-cell transcriptome in children who developed coeliac disease in a prospective study
DIABIMMUNE Study Group, helmik. 2023, julkaisussa: Heliyon. 9, 2, 11 Sivumäärä, e13147.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto3 Lataukset (Pure) -
Serum APOC1 levels are decreased in young autoantibody positive children who rapidly progress to type 1 diabetes
Hirvonen, M. K., Lietzén, N., Moulder, R., Bhosale, S. D., Koskenniemi, J., Vähä-Mäkilä, M., Nurmio, M., Orešič, M., Ilonen, J., Toppari, J., Veijola, R., Hyöty, H., Lähdesmäki, H., Knip, M., Cheng, L. & Lahesmaa, R., 24 syysk. 2023, julkaisussa: Scientific Reports. 13, 1, 11 Sivumäärä, 15941.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto4 Lataukset (Pure) -
Targeted serum proteomics of longitudinal samples from newly diagnosed youth with type 1 diabetes distinguishes markers of disease and C-peptide trajectory
Moulder, R., Välikangas, T., Hirvonen, M. K., Suomi, T., Brorsson, C. A., Lietzén, N., Bruggraber, S. F. A., Overbergh, L., Dunger, D. B., Peakman, M., Chmura, P. J., Brunak, S., Schulte, A. M., Mathieu, C., Knip, M., Elo, L. L. & Lahesmaa, R., 4 elok. 2023, julkaisussa: Diabetologia. 66, 11, s. 1983-1996 14 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto3 Sitaatiot (Scopus)5 Lataukset (Pure) -
2022
A systematic comparison of FOSL1, FOSL2 and BATF-mediated transcriptional regulation during early human Th17 differentiation
Shetty, A., Tripathi, S. K., Junttila, S., Buchacher, T., Biradar, R., Bhosale, S. D., Envall, T., Laiho, A., Moulder, R., Rasool, O., Galande, S., Elo, L. L. & Lahesmaa, R., 20 toukok. 2022, julkaisussa: Nucleic Acids Research. 50, 9, s. 4938-4958 21 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto10 Sitaatiot (Scopus)38 Lataukset (Pure) -
Biomarkers of nanomaterials hazard from multi-layer data
Fortino, V., Kinaret, P. A. S., Fratello, M., Serra, A., Saarimäki, L. A., Gallud, A., Gupta, G., Vales, G., Correia, M., Rasool, O., Ytterberg, J., Monopoli, M., Skoog, T., Ritchie, P., Moya, S., Vázquez-Campos, S., Handy, R., Grafström, R., Tran, L., Zubarev, R., & 11 muuta, jouluk. 2022, julkaisussa: Nature Communications. 13, 1, 3798.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto14 Sitaatiot (Scopus)9 Lataukset (Pure) -
Early DNA methylation changes in children developing beta cell autoimmunity at a young age
Starskaia, I., Laajala, E., Grönroos, T., Härkönen, T., Junttila, S., Kattelus, R., Kallionpää, H., Laiho, A., Suni, V., Tillmann, V., Lund, R., Elo, L. L., Lähdesmäki, H., Knip, M., Kalim, U. U. & Lahesmaa, R., toukok. 2022, julkaisussa: Diabetologia. 65, 5, s. 844-860 17 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto6 Sitaatiot (Scopus)36 Lataukset (Pure) -
Long Intergenic Noncoding RNA MIAT as a Regulator of Human Th17 Cell Differentiation
Khan, M. M., Khan, M. H., Kalim, U. U., Khan, S., Junttila, S., Paulin, N., Kong, L., Rasool, O., Elo, L. L. & Lahesmaa, R., 15 kesäk. 2022, julkaisussa: Frontiers in Immunology. 13, 856762.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto6 Sitaatiot (Scopus)25 Lataukset (Pure) -
Pancreas Whole Tissue Transcriptomics Highlights the Role of the Exocrine Pancreas in Patients With Recently Diagnosed Type 1 Diabetes
Välikangas, T., Lietzén, N., Jaakkola, M. K., Krogvold, L., Eike, M. C., Kallionpää, H., Tuomela, S., Mathews, C., Gerling, I. C., Oikarinen, S., Hyöty, H., Dahl-Jorgensen, K., Elo, L. L. & Lahesmaa, R., 13 huhtik. 2022, julkaisussa: Frontiers in Endocrinology. 13, 861985.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto23 Lataukset (Pure) -
Permutation-based significance analysis reduces the type 1 error rate in bisulfite sequencing data analysis of human umbilical cord blood samples
Laajala, E., Halla-aho, V., Grönroos, T., Kalim, U. U., Vähä-Mäkilä, M., Nurmio, M., Kallionpää, H., Lietzén, N., Mykkänen, J., Rasool, O., Toppari, J., Orešič, M., Knip, M., Lund, R., Lahesmaa, R. & Lähdesmäki, H., 2022, julkaisussa: Epigenetics. 17, 12Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto2 Sitaatiot (Scopus)26 Lataukset (Pure) -
Persistent coxsackievirus B1 infection triggers extensive changes in the transcriptome of human pancreatic ductal cells
Buchacher, T., Honkimaa, A., Välikangas, T., Lietzén, N., Hirvonen, M. K., Laiho, J. E., Sioofy-Khojine, A. B., Eskelinen, E. L., Hyöty, H., Elo, L. L. & Lahesmaa, R., 21 tammik. 2022, julkaisussa: iScience. 25, 1, 103653.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto3 Sitaatiot (Scopus)21 Lataukset (Pure) -
PP2A and Its Inhibitors in Helper T-Cell Differentiation and Autoimmunity
Khan, M. M., Kalim, U. U., Khan, M. H. & Lahesmaa, R., 5 tammik. 2022, julkaisussa: Frontiers in Immunology. 12, 786857.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto12 Sitaatiot (Scopus)21 Lataukset (Pure) -
Type 1 Diabetes in Children With Genetic Risk May Be Predicted Very Early With a Blood miRNA
Suomi, T., Kalim, U. U., Rasool, O., Laiho, A., Kallionpää, H., Vähä-Mäkilä, M., Nurmio, M., Mykkänen, J., Härkönen, T., Hyöty, H., Ilonen, J., Veijola, R., Toppari, J., Knip, M., Elo, L. L. & Lahesmaa, R., huhtik. 2022, julkaisussa: Diabetes Care. 45, 4, s. e77-e79Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Katsaus › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto1 Sitaatiot (Scopus)18 Lataukset (Pure) -
Umbilical cord blood DNA methylation in children who later develop type 1 diabetes
Laajala, E., Kalim, U. U., Grönroos, T., Rasool, O., Halla-aho, V., Konki, M., Kattelus, R., Mykkänen, J., Nurmio, M., Vähä-Mäkilä, M., Kallionpää, H., Lietzén, N., Ghimire, B. R., Laiho, A., Hyöty, H., Elo, L. L., Ilonen, J., Knip, M., Lund, R. J., Orešič, M., & 4 muuta, syysk. 2022, julkaisussa: Diabetologia. 65, 9, s. 1534-1540 7 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto3 Sitaatiot (Scopus)16 Lataukset (Pure) -
2021
Interactome Networks of FOSL1 and FOSL2 in Human Th17 Cells
Shetty, A., Bhosale, S. D., Tripathi, S. K., Buchacher, T., Biradar, R., Rasool, O., Moulder, R., Galande, S. & Lahesmaa, R., 28 syysk. 2021, julkaisussa: ACS Omega. 6, 38, s. 24834-24847 14 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto4 Sitaatiot (Scopus)30 Lataukset (Pure) -
Quantitative genome-scale metabolic modeling of human CD4+ T cell differentiation reveals subset-specific regulation of glycosphingolipid pathways
Sen, P., Andrabi, S. B. A., Buchacher, T., Khan, M. M., Kalim, U. U., Lindeman, T. M., Alves, M. A., Hinkkanen, V., Kemppainen, E., Dickens, A. M., Rasool, O., Hyötyläinen, T., Lahesmaa, R. & Orešič, M., 9 marrask. 2021, julkaisussa: Cell Reports. 37, 6, 109973.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access7 Sitaatiot (Scopus) -
2020
CIP2A Constrains Th17 Differentiation by Modulating STAT3 Signaling
Khan, M. M., Ullah, U., Khan, M. H., Kong, L., Moulder, R., Välikangas, T., Bhosale, S. D., Komsi, E., Rasool, O., Chen, Z., Elo, L. L., Westermarck, J. & Lahesmaa, R., 2020, julkaisussa: iScience. 23, 3Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto10 Sitaatiot (Scopus)45 Lataukset (Pure) -
Plasma cell-free DNA methylation marks for episodic memory impairment: a pilot twin study
Konki, M., Lindgren, N., Kyläniemi, M., Venho, R., Laajala, E., Ghimire, B., Lahesmaa, R., Kaprio, J., Rinne, J. O. & Lund, R. J., 2020, julkaisussa: Scientific Reports. 10, 1Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access8 Sitaatiot (Scopus) -
The role of Interleukin-32 in autoimmunity
de Albuquerque, R., Komsi, E., Starskaia, I., Ullah, U. & Lahesmaa, R., 2020, julkaisussa: Scandinavian Journal of Immunology.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu
Open access13 Sitaatiot (Scopus) -
2019
An additive Gaussian process regression model for interpretable non-parametric analysis of longitudinal data
Cheng, L., Ramchandran, S., Vatanen, T., Lietzén, N., Lahesmaa, R., Vehtari, A. & Lähdesmaki, H., 2019, julkaisussa: Nature Communications. 10, s. – 11 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
68 Sitaatiot (Scopus) -
Genome-wide CRISPR Screens in T Helper Cells Reveal Pervasive Crosstalk between Activation and Differentiation
Henriksson, J., Chen, X., Gomes, T., Ullah, U., K B, M., Miragaia, R., Duddy, G., Pramanik, J., Yusa, K., Lahesmaa, R. & S A, T., 2019, julkaisussa: Cell. 176, 4, s. 882–896 33 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
108 Sitaatiot (Scopus) -
Quantitative Proteomics Reveals the Dynamic Protein Landscape during Initiation of Human Th17 Cell Polarization
Tripathi, S. K., Välikangas, T., Shetty, A., Moin Khan, M., Moulder, R., Bhosale, S. D., Komsi, E., Salo, V., Sales De Albuquerque, R., Rasool, O., Galande, S., Elo, L. L. & Lahesmaa, R., 2019, julkaisussa: iScience. 11, s. 334–355 44 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
19 Sitaatiot (Scopus) -
2018
Analysis of the plasma proteome using iTRAQ and TMT-based Isobaric labeling
Moulder, R., Bhosale, SD., Goodlett, DR. & Lahesmaa, R., 2018, julkaisussa: Mass Spectrometry Reviews. 37, 5, s. 583–606 24 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu
112 Sitaatiot (Scopus) -
Characterization and non-parametric modeling of the developing serum proteome during infancy and early childhood
Lietzen, N., Cheng, L., Moulder, R., Siljander, H., Laajala, E., Harkonen, T., Peet, A., Vehtari, A., Tillmann, V., Knip, M., Lahdesmaki, H. & Lahesmaa, R., 2018, julkaisussa: Scientific Reports. 8, s. – 13 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
9 Sitaatiot (Scopus) -
Enterovirus-associated changes in blood transcriptomic profiles of children with genetic susceptibility to type 1 diabetes
Niina, L., Le T. T., A., K., J. M., Henna, K., Sami, O., Juha, M., Mikael, K., Riitta, V., Jorma, I., Jorma, T., Heikki, H., Lahesmaa, R. & L., E. L., 2018, julkaisussa: Diabetologia. 61, 2, s. 381–388 8 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
11 Sitaatiot (Scopus) -
Immunological biomarkers for the development and progression of type 1 diabetes
Mathieu, C., Lahesmaa, R., Bonifacio, E., Achenbach, P. & Tree, T., 2018, julkaisussa: Diabetologia. 61, 11, s. 2252–2258 7 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu
44 Sitaatiot (Scopus) -
Macrophage sensing of single-walled carbon nanotubes via Toll-like receptors
Mukherjee, SP., Bondarenko, O., Kohonen, P., Andon, FT., Brzicova, T., Gessner, I., Mathur, S., Bottini, M., Calligari, P., Stella, L., Kisin, E., Shvedova, A., Autio, R., Salminen-Mankonen, H., Lahesmaa, R. & Fadeel, B., 2018, julkaisussa: Scientific Reports. 8, s. – 17 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
60 Sitaatiot (Scopus) -
Serum Proteomic Profiling to Identify Biomarkers of Premature Carotid Atherosclerosis
Bhosale, SD., Moulder, R., Venalainen, MS., Koskinen, JS., Pitkanen, N., Juonala, MT., MAP, K., Lehtimaki, TJ., JSA, V., Elo, LL., Goodlett, DR., Lahesmaa, R. & Raitakari, OT., 2018, julkaisussa: Scientific Reports. 8, s. – 9 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
17 Sitaatiot (Scopus) -
snpEnrichR: analyzing co-localization of SNPs and their proxies in genomic regions
Nousiainen, K., Kanduri, K., Ricano-Ponce, I., Wijmenga, C., Lahesmaa, R., Kumar, V. & Lahdesmaki, H., 2018, julkaisussa: Bioinformatics. 34, s. 4112–4114 3 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
1 Sitaatiot (Scopus) -
Time-resolved transcriptome and proteome landscape of human regulatory T cell (Treg) differentiation reveals novel regulators of FOXP3
Schmidt, A., Marabita, F., Kiani, N. A., Gross, C. C., Johansson, H. J., Éliás, S., Rautio, S., Eriksson, M., Jude Fernandes, S., Silberberg, G., Ullah, U., Bhatia, U., Lähdesmäki, H., Lehtiö, J., Gomez-Cabrero, D., Wiendl, H., Lahesmaa, R. & Tegnér, J., 2018, julkaisussa: BMC Biology. 16, s. – 35 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
20 Sitaatiot (Scopus) -
Transcriptional Repressor HIC1 Contributes to Suppressive Function of Human Induced Regulatory T Cells
Ullah, U., Bilal Ahmad Andrabi, S., Kumar Tripathi, S., Dirasantha, O., Kanduri, K., Rautio, S., Gross, C. C., Lehtimäki, S., Bala, K., Tuomisto, J., Bhatia, U., Chakroborty, D., Elo, L. L., Lähdesmäki, H., Wiendl, H., Rasool, O. & Lahesmaa, R., 2018, julkaisussa: Cell Reports. 22, 8, s. 2094–2106 13 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
32 Sitaatiot (Scopus) -
2016
CIP2A Promotes T-Cell Activation and Immune Response to Listeria monocytogenes Infection
Côme, C., Cvrljevic, A., Moin Khan, M., Treise, I., Adler, T., Antonio Aguilar-Pimentel, J., Au-Yeung, B., Sittig, E., Daniel Laajala, T., Chen, Y., Oeder, S., Calzada-Wack, J., Horsch, M., Aittokallio, T., Busch, D. H., Ollert, M. W., Neff, F., Beckers, J., Gailus-Durner, V., Fuchs, H., & 4 muuta, 2016, julkaisussa: PLoS ONE. 11, 4, s. – 18 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
15 Sitaatiot (Scopus) -
2010
Activating transcription factor 3 is a positive regulator of human IFNG gene expression.
Filén, S., Ylikoski, E., Tripathi, S., West, A., Björkman, M., Nyström, J., Ahlfors, H., Coffey, E., Rao, KV., Rasool, O. & Lahesmaa, R., maalisk. 2010, julkaisussa: Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950).Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
34 Sitaatiot (Scopus)