Publikationer per år
Publikationer per år
- 1 - 50 av 56 resultat
Sökresultat
-
2024
CellTracksColab is a platform that enables compilation, analysis, and exploration of cell tracking data
Gómez-de-Mariscal, E., Grobe, H., Pylvänäinen, J. W., Xénard, L., Henriques, R., Tinevez, J.-Y. & Jacquemet, G., 8 aug. 2024, I: PLoS Biology. 22, 8, 19 s., e3002740.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil3 Nedladdningar (Pure) -
DL4MicEverywhere: deep learning for microscopy made flexible, shareable and reproducible
AI4Life Horizon Europe Program Consortium, juni 2024, I: Nature Methods. 21, 6, s. 925-927 3 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Brev › Vetenskaplig › Peer review
1 Citeringar (Scopus) -
Harnessing artificial intelligence to reduce phototoxicity in live imaging
Gómez-de-Mariscal, E., Del Rosario, M., Pylvänäinen, J. W., Jacquemet, G. & Henriques, R., 1 feb. 2024, I: Journal of Cell Science. 137, 3Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil1 Nedladdningar (Pure) -
TLNRD1 is a CCM complex component and regulates endothelial barrier integrity
Ball, N. J., Ghimire, S., Follain, G., Pajari, A. O., Wurzinger, D., Vaitkevičiūtė, M., Cowell, A. R., Berki, B., Ivaska, J., Paatero, I., Goult, B. T. & Jacquemet, G., 2 sep. 2024, I: Journal of Cell Biology. 223, 9, 22 s., e202310030.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil2 Nedladdningar (Pure) -
2023
Fast4DReg - fast registration of 4D microscopy datasets
Pylvänäinen, J. W., Laine, R. F., Saraiva, B. M. S., Ghimire, S., Follain, G., Henriques, R. & Jacquemet, G., 15 feb. 2023, I: Journal of Cell Science. 136, 4Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil3 Citeringar (Scopus)32 Nedladdningar (Pure) -
High-fidelity 3D live-cell nanoscopy through data-driven enhanced super-resolution radial fluctuation
Laine, R. F., Heil, H. S., Coelho, S., Nixon-Abell, J., Jimenez, A., Wiesner, T., Martínez, D., Galgani, T., Régnier, L., Stubb, A., Follain, G., Webster, S., Goyette, J., Dauphin, A., Salles, A., Culley, S., Jacquemet, G., Hajj, B., Leterrier, C. & Henriques, R., dec. 2023, I: Nature Methods. 20, 12, s. 1949-1956 25 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil15 Citeringar (Scopus)28 Nedladdningar (Pure) -
Live-cell imaging in the deep learning era
Pylvänäinen, J. W., Gómez-de-Mariscal, E., Henriques, R. & Jacquemet, G., dec. 2023, I: Current Opinion in Cell Biology. 85, 13 s., 102271.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review
Öppen tillgångFil8 Citeringar (Scopus)78 Nedladdningar (Pure) -
Mapping the Localization of Proteins Within Filopodia Using FiloMap
Jacquemet, G., 19 jan. 2023, Cell Migration in Three Dimensions. Margadant, C. (red.). Humana press, Vol. 2608. s. 51-61 11 s. (Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)).Forskningsoutput: Kapitel i bok/konferenshandling › Kapitel › Vetenskaplig › Peer review
1 Citeringar (Scopus) -
Myosin-X recruits lamellipodin to filopodia tips
Popović, A., Miihkinen, M., Ghimire, S., Saup, R., Grönloh, M. L. B., Ball, N. J., Goult, B. T., Ivaska, J. & Jacquemet, G., 1 mars 2023, I: Journal of Cell Science. 136, 5, jcs260574.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil3 Citeringar (Scopus)74 Nedladdningar (Pure) -
2022
Cell scientist to watch – Guillaume Jacquemet
Jacquemet, G., okt. 2022Forskningsoutput: Övriga bidrag › Peer review
-
DeepBacs for multi-task bacterial image analysis using open-source deep learning approaches
Spahn, C., Gómez-de-Mariscal, E., Laine, R. F., Pereira, P. M., von Chamier, L., Conduit, M., Pinho, M. G., Jacquemet, G., Holden, S., Heilemann, M. & Henriques, R., 9 juli 2022, I: Communications biology. 5, 1, 18 s., 688.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil29 Citeringar (Scopus)36 Nedladdningar (Pure) -
MYO10-filopodia support basement membranes at pre-invasive tumor boundaries
Peuhu, E., Jacquemet, G., Scheele, C. L. G. J., Isomursu, A., Laisne, M.-C., Koskinen, L. M., Paatero, I., Thol, K., Georgiadou, M., Guzmán, C., Koskinen, S., Laiho, A., Elo, L. L., Boström, P., Hartiala, P., van Rheenen, J. & Ivaska, J., 24 okt. 2022, I: Developmental Cell. 57, 20, s. 2350-2364.e7 24 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil13 Citeringar (Scopus)25 Nedladdningar (Pure) -
TrackMate 7: integrating state-of-the-art segmentation algorithms into tracking pipelines
Ershov, D., Phan, M.-S., Pylvänäinen, J. W., Rigaud, S. U., Le Blanc, L., Charles-Orszag, A., Conway, J. R. W., Laine, R. F., Roy, N. H., Bonazzi, D., Duménil, G., Jacquemet, G. & Tinevez, J.-Y., juli 2022, I: Nature Methods. 19, 7, s. 829-832Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Fil245 Citeringar (Scopus)67 Nedladdningar (Pure) -
2021
Avoiding a replication crisis in deep-learning-based bioimage analysis
Laine, R. F., Arganda-Carreras, I., Henriques, R. & Jacquemet, G., okt. 2021, I: Nature Methods. 18, s. 1136-1144Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig
Öppen tillgång57 Citeringar (Scopus) -
Cargo-specific recruitment in clathrin- and dynamin-independent endocytosis
Moreno-Layseca, P., Jäntti, N. Z., Godbole, R., Sommer, C., Jacquemet, G., Al-Akhrass, H., Conway, J. R. W., Kronqvist, P., Kallionpää, R. E., Oliveira-Ferrer, L., Cervero, P., Linder, S., Aepfelbacher, M., Zauber, H., Rae, J., Parton, R. G., Disanza, A., Scita, G., Mayor, S. & Selbach, M. & 2 andra, , 6 okt. 2021, I: Nature Cell Biology. 23, 10, s. 1073-1084Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil33 Citeringar (Scopus)38 Nedladdningar (Pure) -
Deep learning to analyse microscopy images
Jacquemet, G., 2021, I: Biochemist. 43, 5, s. 60-64 5 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig
Öppen tillgång5 Citeringar (Scopus) -
Democratising deep learning for microscopy with ZeroCostDL4Mic
von Chamier, L., Laine, R. F., Jukkala, J., Spahn, C., Krentzel, D., Nehme, E., Lerche, M., Hernández-Pérez, S., Mattila, P. K., Karinou, E., Holden, S., Solak, A. C., Krull, A., Buchholz, T.-O., Jones, M. L., Royer, L. A., Leterrier, C., Shechtman, Y., Jug, F. & Heilemann, M. & 2 andra, , dec. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 2276.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång264 Citeringar (Scopus) -
Et in Arcadia Ego
Weckman, J.-K. (Designer), Jacquemet, G. (Designer) & Hellsten, L. (Producent), sep. 2021Forskningsoutput: Icke-textbaserad output › Framförande › Konst i samproduktion
-
Imaging in focus: An introduction to denoising bioimages in the era of deep learning
Laine, R. F., Jacquemet, G. & Krull, A., nov. 2021, I: The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 140Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review
Öppen tillgångFil29 Citeringar (Scopus)37 Nedladdningar (Pure) -
Improving the knock-in efficiency of the MOF-encapsulated CRISPR/Cas9 system through controllable embedding structures
Liu, C., Xu, X., Koivisto, O., Zhou, W., Jacquemet, G., Rosenholm, J. M. & Zhang, H., 1 sep. 2021, I: Nanoscale. 13, 39, s. 16525-16532 8 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil16 Citeringar (Scopus)57 Nedladdningar (Pure) -
Myosin-X and talin modulate integrin activity at filopodia tips
Miihkinen, M., Grönloh, M. L. B., Popović, A., Vihinen, H., Jokitalo, E., Goult, B. T., Ivaska, J. & Jacquemet, G., 14 sep. 2021, I: Cell Reports. 36, 11, 109716.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång28 Citeringar (Scopus) -
SHANK3 conformation regulates direct actin binding and crosstalk with Rap1 signaling
Salomaa, S. I., Miihkinen, M., Kremneva, E., Paatero, I., Lilja, J., Jacquemet, G., Vuorio, J., Antenucci, L., Kogan, K., Hassani Nia, F., Hollos, P., Isomursu, A., Vattulainen, I., Coffey, E. T., Kreienkamp, H.-J., Lappalainen, P. & Ivaska, J., 22 nov. 2021, I: Current Biology. 31, 22, s. 4956-4970.e9Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång18 Citeringar (Scopus) -
Talin mechanosensitivity is modulated by a direct interaction with cyclin-dependent kinase-1
Gough, R. E., Jones, M. C., Zacharchenko, T., Le, S., Yu, M., Jacquemet, G., Muench, S. P., Yan, J., Humphries, J. D., Jørgensen, C., Humphries, M. J. & Goult, B. T., 1 juli 2021, I: Journal of Biological Chemistry. 297, 1, 100837.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång29 Citeringar (Scopus) -
Talin rod domain–containing protein 1 (TLNRD1) is a novel actin-bundling protein which promotes filopodia formation
Cowell, A. R., Jacquemet, G., Singh, A. K., Varela, L., Nylund, A. S., Ammon, Y.-C., Brown, D. G., Akhmanova, A., Ivaska, J. & Goult, B. T., 6 sep. 2021, I: Journal of Cell Biology. 220, 9, e202005214.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång8 Citeringar (Scopus) -
2020
Automated cell tracking using StarDist and TrackMate
Fazeli, E., Roy, N. H., Follain, G., Laine, R. F., Chamier, L. V., Hänninen, P. E., Eriksson, J. E., Tinevez, J.-Y. & Jacquemet, G., 28 okt. 2020, I: f1000research. 9, 1279.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil36 Citeringar (Scopus)90 Nedladdningar (Pure) -
Effective Delivery of the CRISPR/Cas9 System Enabled by Functionalized Mesoporous Silica Nanoparticles for GFP-Tagged Paxillin Knock-In
Xu, X., Koivisto, O., Liu, C., Zhou, J., Miihkinen, M., Jacquemet, G., Wang, D., Rosenholm, J. M., Shu, Y. & Zhang, H., 2020, I: Advanced therapeutics. 4, 1, s. 2000072 12 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång25 Citeringar (Scopus) -
Fluctuation-Based Super-Resolution Traction Force Microscopy
Stubb, A., Laine, R. F., Miihkinen, M., Hamidi, H., Guzmán, C., Henriques, R., Jacquemet, G. & Ivaska, J., 2020, I: Nano Letters. 20, 4, s. 2230–2245Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil44 Citeringar (Scopus)63 Nedladdningar (Pure) -
The cell biologist's guide to super-resolution microscopy
Jacquemet, G., Carisey, A. F., Hamidi, H., Henriques, R. & Leterrier, C., 2020, I: Journal of Cell Science. 133, 11, 9 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil101 Citeringar (Scopus)153 Nedladdningar (Pure) -
2019
Cell matrix adhesion in cell migration
R.W., C. J. & Jacquemet, G., 2019, I: Essays in Biochemistry. s. –Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review
Fil53 Citeringar (Scopus)266 Nedladdningar (Pure) -
Filopodia Quantification Using FiloQuant.
Jacquemet, G., Hamidi & Ivaska, 2019, Computer Optimized Microscopy. Rebollo, E. & Bosch, M. (red.). Humana Press, s. 359–373Forskningsoutput: Kapitel i bok/konferenshandling › Kapitel › Vetenskaplig › Peer review
Fil15 Citeringar (Scopus)315 Nedladdningar (Pure) -
Filopodome Mapping Identifies p130Cas as a Mechanosensitive Regulator of Filopodia Stability.
Jacquemet, G., Stubb, Saup, Miihkinen, Kremneva, Hamidi & Ivaska, 2019, I: Current Biology. 29, 2, s. 202–216.e7Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
76 Citeringar (Scopus) -
Superresolution architecture of cornerstone focal adhesions in human pluripotent stem cells.
Stubb, Guzmán, Närvä, Aaron, Chew, Saari, Miihkinen, Jacquemet, G. & Ivaska, 2019, I: Nature Communications. 10, 1, s. –Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
34 Citeringar (Scopus) -
2018
Endothelial cells cope with hypoxia-induced depletion of ATP via activation of cellular purine turnover and phosphotransfer networks.
Losenkova, Zuccarini, Helenius, Jacquemet, G., Gerasimovskaya, Tallgren, Jalkanen & Yegutkin, 2018, I: BBA - Molecular Basis of Disease. 1864, 5 Pt A, s. 1804–1815Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
20 Citeringar (Scopus) -
Mitosis-Resistant Adhesions Provide Molecular Memory to Dividing Cells
Jacquemet, G. & Ivaska, J., 2018, I: Developmental Cell. 45, 1, s. 5–7Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig
4 Citeringar (Scopus) -
Targeting β1-integrin inhibits vascular leakage in endotoxemia
Hakanpaa, L., Kiss, E., Jacquemet, G., Miinalainen, I., Lerche, M., Guzman, C., Mervaala, E., Eklund, L., Ivaska, J. & Saharinen, P., 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences. 115, s. – 10 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
69 Citeringar (Scopus) -
2017
AMPK negatively regulates tensin-dependent integrin activity
Georgiadou, Lilja, Jacquemet, G., Guzmán, Rafaeva, Alibert, Yan, Sahgal, Lerche, Manneville, Mäkelä & Ivaska, 2017, I: Journal of Cell Biology. 216, 4, s. 1107–1121Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
75 Citeringar (Scopus) -
Cell-derived matrices for studying cell proliferation and directional migration in a complex 3D microenvironment
Kaukonen, Jacquemet, G., Hamidi & Ivaska, 2017, I: Nature Protocols. 12, 11, s. 2376–2390Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Fil79 Citeringar (Scopus)113 Nedladdningar (Pure) -
FiloQuant reveals increased filopodia density during breast cancer progression
Jacquemet, G., Paatero, I., Carisey, A., Padzik, A., Orange, J., Hamidi, H. & Ivaska, J., 2017, I: Journal of Cell Biology. 216, 10, s. 3387–3403 17 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
102 Citeringar (Scopus) -
SHANK proteins limit integrin activation by directly interacting with Rap1 and R-Ras.
Lilja, Zacharchenko, Georgiadou, Jacquemet, G., Franceschi, D., Peuhu, Hamidi, Pouwels, Martens, Nia, Beifuss, Boeckers, Kreienkamp, Barsukov & Ivaska, 2017, I: Nature Cell Biology. 19, 4, s. 292–305Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
98 Citeringar (Scopus) -
SHARPIN regulates collagen architecture and ductal outgrowth in the developing mouse mammary gland.
Peuhu, Kaukonen, Lerche, Saari, Guzmán, Rantakari, Franceschi, D., Wärri, Georgiadou, Jacquemet, G., Mattila, Virtakoivu, Liu, Attieh, Silva, Betz, Sundberg, Salmi, Deugnier & Eliceiri & 1 andra, , 2017, I: EMBO Journal. 36, 2, s. 165–182Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
33 Citeringar (Scopus) -
The Sharpin interactome reveals a role for Sharpin in lamellipodium formation via the Arp2/3 complex.
Khan, Salomaa, Jacquemet, G., Butt, Miihkinen, Deguchi, Kremneva, Lappalainen, Humphries & Pouwels, 2017, I: Journal of Cell Science. 130, 18, s. 3094–3107Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
10 Citeringar (Scopus) -
2016
L-type calcium channels regulate filopodia stability and cancer cell invasion downstream of integrin signalling
Jacquemet, G., Baghirov, H., Georgiadou, M., Sihto, H., Peuhu, E., Cettour-Janet, P., He, T., Perälä, M., Kronqvist, P., Joensuu, H. & Ivaska, J., 2016, I: Nature Communications.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
120 Citeringar (Scopus) -
L-type calcium channels regulate filopodia stability and cancer cell invasion downstream of integrin signalling.
Jacquemet, G., Baghirov, H., Georgiadou, M., Sihto, H., Peuhu, E., Cettour-Janet, P., Tao, H., Perälä, M., Kronqvist, P., Joensuu, H. & Ivaska, J., 2016, I: Nature Communications. 7, s. –Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
120 Citeringar (Scopus) -
Modulation of FAK and Src adhesion signaling occurs independently of adhesion complex composition.
Horton, E. R., Humphries, J. D., Stutchbury, B., Jacquemet, G., Ballestrem, C., Barry, S. T. & Humphries, M. J., 2016, I: Journal of Cell Biology. 212, 3, s. 349–364Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
76 Citeringar (Scopus) -
Talin-KANK1 interaction controls the recruitment of cortical microtubule stabilizing complexes to focal adhesions.
P Bouchet, B., E Gough, R., Ammon, Y.-C., van de Willige, D., Post, H., Jacquemet, G., Maarten Altelaar, A., JR Heck, A., T Goult, B. & Akhmanova, A., 2016, I: eLife. 5, s. –Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
140 Citeringar (Scopus) -
2015
A proteomic approach reveals integrin activation state-dependent control of microtubule cortical targeting.
Byron, Askari, Humphries, Jacquemet, G., Koper, Warwood, Choi, Stroud, Chen, Knight & Humphries, 2015, I: Nature Communications. 6, s. –Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
59 Citeringar (Scopus) -
Defining the phospho-adhesome through the phosphoproteomic analysis of integrin signalling.
Robertson, J., Jacquemet, G., Byron, A., Jones, M. C., Warwood, S., Selley, J. N., Knight, D., Humphries, J. D. & Humphries, M. J., 2015, I: Nature Communications. 6, s. –Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
106 Citeringar (Scopus) -
Endocytic Trafficking of Integrins in Cell Migration
Paul, Jacquemet, G. & Caswell, 2015, I: Current Biology. 25, 22, s. R1092–R1105Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review
196 Citeringar (Scopus) -
Endothelial destabilization by angiopoietin-2 via integrin β1 activation.
Hakanpää, L., Sipilä, T., Leppänen, V.-M., Gautam, P., Nurmi, H., Jacquemet, G., Eklund, L., Ivaska, J., Alitalo, K. & Saharinen, P., 2015, I: Nature Communications. 6, s. –Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
220 Citeringar (Scopus) -
Filopodia in cell adhesion, 3D migration and cancer cell invasion
Jacquemet, G., Hamidi, H. & Ivaska, J., 2015, I: Current Opinion in Cell Biology. 36, s. 23–31Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review
370 Citeringar (Scopus)