Biokemia ja solubiologia

Hakutulokset

• eSRRF - Supplementary Data

  Laine, R. F. (Luoja), Heil, H. S. (Luoja), Coelho, S. (Luoja), Nixon-Abell, J. (Luoja), Jimenez, A. (Luoja), Galgani, T. (Luoja), Stubb, A. (Luoja), Follain, G. (Luoja), Culley, S. (Luoja), Jacquemet, G. (Luoja), Hajj, B. (Luoja), Leterrier, C. (Luoja) & Henriques, R. (Luoja), Zenodo, 17 huhtik. 2022

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.6466473, https://zenodo.org/record/6466473

  Tietoaineisto

• Combining StarDist and TrackMate example 3 - Flow chamber dataset

  Follain, G. (Luoja) & Jacquemet, G. (Luoja), Zenodo, 17 syysk. 2020

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.4034939, https://zenodo.org/record/4034939

  Tietoaineisto

• Keratin 7 in inflammatory bowel disease

  Polari, L. (Luoja), Toivola, D. (Avustaja (contributor)), Tenhami, M. (Avustaja (contributor)), Voutilainen, M. (Avustaja (contributor)) & Kallajoki , M. (Avustaja (contributor)), Ministery of Education and Culture, 20 syysk. 2022

  DOI - pysyväislinkki: 10.23729/edd4abd6-9d04-491c-b11a-46aff225ce45

  Tietoaineisto

• Pix2pix training dataset for predicting nuclei form brightfield images

  Pylvänäinen, J. W. (Luoja) & Jacquemet, G. (Luoja), Zenodo, 6 marrask. 2023

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.10074471, https://zenodo.org10074471

  Tietoaineisto

• Archived source code for Cargo-specific recruitment in clathrin and dynamin-independent endocytosis

  Jacquemet, G. (Luoja), Zenodo, 26 toukok. 2021

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.4812018, https://zenodo.org/record/4812018

  Tietoaineisto

• Supplementary material 6 from: Wejnerowski Ł, Aykut TO, Pełechata A, Rybak M, Dulić T, Meriluoto J, Dziuba MK (2022) Plankton hitch-hikers on naturalists' instruments as silent intruders of aquatic ecosystems: current risks and possible prevention.

  Wejnerowski, Ł. (Luoja), Aykut, T. O. (Luoja), Pełechata, A. (Luoja), Rybak, M. (Luoja), Dulić, T. (Luoja), Meriluoto, J. (Luoja) & Dziuba, M. K. (Luoja), NeoBiota, 27 toukok. 2022

  DOI - pysyväislinkki: 10.3897/neobiota.73.82636.suppl6, https://zenodo.org/record/6585788

  Tietoaineisto

• StarDist_AsPC1_Lifeact

  Follain, G. (Luoja), Ghimire, S. (Luoja), Pylvänäinen, J. (Luoja), Ivaska, J. (Luoja) & Jacquemet, G. (Luoja), Zenodo, 29 elok. 2024

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.13442128, https://zenodo.org/records/13442128

  Tietoaineisto

• Fluorescence microscopy, image analysis and quantitative PCR data underlying the publication “Engineered patterns of Notch ligands Jag1 and Dll4 elicit differential spatial control of endothelial sprouting”

  Tiemeijer, L. A. (Luoja), Ristori, T. (Luoja), Stassen, O. M. J. A. (Luoja), Ahlberg, J. (Luoja), de Bijl, J. J. J. (Luoja), Chen, C. S. (Luoja), Bentley, K. (Luoja), Bouten, C. V. C. (Luoja) & Sahlgren, C. M. (Luoja), 4TU.ResearchData, 6 toukok. 2022

  DOI - pysyväislinkki: 10.4121/19235784, https://data.4tu.nl/articles/_/19235784

  Tietoaineisto

• StarDist_BF_cancer_cell_dataset_20x

  Follain, G. (Luoja), Ghimire, S. (Luoja), Pylvänäinen, J. (Luoja), Ivaska, J. (Luoja) & Jacquemet, G. (Luoja), Zenodo, 26 tammik. 2024

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.10572122, https://zenodo.org/records/10572122

  Tietoaineisto

• SReD - Figure's data

  Mendes, A. (Luoja), Saraiva, B. (Luoja), Jacquemet, G. (Luoja), Mamede, J. I. (Luoja), Leterrier, C. (Luoja) & Henriques, R. (Luoja), Zenodo, 15 syysk. 2024

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.13764726, https://zenodo.org/records/13764726

  Tietoaineisto

• StarDist_BF_cancer_cell_dataset_10x

  Follain, G. (Luoja), Ghimire, S. (Luoja), Pylvänäinen, J. (Luoja), Ivaska, J. (Luoja) & Jacquemet, G. (Luoja), Zenodo, 12 elok. 2024

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.13304399, https://zenodo.org/records/13304399

  Tietoaineisto

• StarDist_HUVEC_nuclei_dataset

  Follain, G. (Luoja), Ghimire, S. (Luoja), Pylvänäinen, J. (Luoja), Ivaska, J. (Luoja) & Jacquemet, G. (Luoja), Zenodo, 5 helmik. 2024

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.10617532, https://zenodo.org/records/10617532

  Tietoaineisto

• CellTracksColab - Filopodia dataset

  Jacquemet, G. (Luoja), Gómez-de-Mariscal, E. (Luoja), Grobe, H. (Luoja), Pylvänäinen, J. (Luoja), Xénard, L. (Luoja), Henriques, R. (Luoja) & Tinevez, J.-Y. (Luoja), Zenodo, 20 tammik. 2024

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.11285514, https://zenodo.org/records/11285514

  Tietoaineisto

• pix2pix_HUVEC_nuclei_immuno_cells_dataset

  Follain, G. (Luoja), Ghimire, S. (Luoja), Pylvänäinen, J. (Luoja), Ivaska, J. (Luoja) & Jacquemet, G. (Luoja), Zenodo, 5 helmik. 2024

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.10617565, https://zenodo.org/records/10617565

  Tietoaineisto

• Data belonging to the publication: "Computational analysis of the role of mechanosensitive Notch signaling in arterial adaptation to hypertension"

  Asten, van, J. (Luoja), Ristori, T. (Luoja), Nolan, D. (Luoja), Lally, C. (Luoja), Baaijens, F. (Luoja), Sahlgren, C. (Luoja) & Loerakker, S. (Luoja), 4TU.ResearchData, 7 heinäk. 2022

  DOI - pysyväislinkki: 10.4121/20237562, https://data.4tu.nl/articles/_/20237562

  Tietoaineisto

• pix2pix_HUVEC_juctions_dataset

  Follain, G. (Luoja), Ghimire, S. (Luoja), Pylvänäinen, J. (Luoja), Ivaska, J. (Luoja) & Jacquemet, G. (Luoja), Zenodo, 2 helmik. 2024

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.10611092, https://zenodo.org/records/10611092

  Tietoaineisto

• Data underlying the publication: "Mechanosensitivity of Jagged–Notch signaling can induce a switch-type behavior in vascular homeostasis"

  Loerakker, S. (Luoja), Stassen, O. (Luoja), ter Huurne, F. M. (Luoja), Boareto, M. (Luoja), Bouten, C. V. C. (Luoja) & Sahlgren, C. (Luoja), 4TU.ResearchData, 26 toukok. 2020

  DOI - pysyväislinkki: 10.4121/uuid:24f5a9fe-3864-4cc5-95d5-cabf9425dd70

  Tietoaineisto

• Schema for MariaDB database that has pathogenicity predictions for a gene

  Lehtonen, J. V. (Luoja), Zenodo, 3 helmik. 2025

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.14793842, https://zenodo.org/records/14793842

  Tietoaineisto

• SynGAPMissenseServer website

  Lehtonen, J. V. (Luoja), Zenodo, 3 helmik. 2025

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.14793901, https://zenodo.org/records/14793901

  Tietoaineisto

• Data underlying the publication: "Shear stress induces expression, intracellular reorganization and enhanced Notch activation potential of Jagged1”

  Driessen, R. (Luoja), Stassen, O. (Luoja), Sjöqvist, M. (Luoja), Suarez Rodriguez, F. (Luoja), Grolleman, J. (Luoja), Bouten, C. V. C. (Luoja) & Sahlgren, C. (Luoja), 4TU.ResearchData, 6 toukok. 2020

  DOI - pysyväislinkki: 10.4121/uuid:494312a5-70c9-4218-b348-ca67972e20b4

  Tietoaineisto

• ERK activity in migrating MDA-MB-231 cells (clover-ERK-KTR + sir-DNA)

  Pylvänäinen, J. W. (Luoja), Conway, J. R. (Luoja) & Jacquemet, G. (Luoja), Zenodo, 11 syysk. 2023

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.8347775, https://zenodo.org/record/8347775

  Tietoaineisto

• Data belonging to the publication "A multiscale computational model of arterial growth and remodeling including Notch signaling"

  van Asten, J. (Luoja), Latorre, M. (Luoja), Karakaya, C. (Luoja), Baaijens, F. (Luoja), Sahlgren, C. (Luoja), Ristori, T. (Luoja), Humphrey, J. (Luoja) & Loerakker, S. (Luoja), 4TU.ResearchData, 18 lokak. 2023

  DOI - pysyväislinkki: 10.4121/22040729, https://data.4tu.nl/datasets/9fe0ab83-7577-4cc0-8fc1-ebc9e6df297a

  Tietoaineisto

• Stardist model and training dataset for automated tracking of MDA-MB-231 and BT20 cells

  Al-Akhrass, H. (Luoja), Ivaska, J. (Luoja) & Jacquemet, G. (Luoja), Zenodo, 26 toukok. 2021

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.4811213, https://zenodo.org/record/4811213

  Tietoaineisto

• Noisy nuclei dataset for testing deep learning-based denoising tools

  Jacquemet, G. (Luoja), Zenodo, 2 jouluk. 2021

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.5750174, https://zenodo.org/record/5750174

  Tietoaineisto

• ZeroCostDL4Mic - YoloV2 example training and test dataset

  Jacquemet, G. (Luoja) & Chamier, L. V. (Luoja), Zenodo, 13 heinäk. 2020

  DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.3941908, https://zenodo.org/record/3941908

  Tietoaineisto